关于KEGG
KEGG 项目于1995年在日本人类基因组计划框架下启动，目标是建立一套参考资源，帮助研究者从基因组序列数据出发理解细胞、个体乃至生态系统等生物系统的高层次功能。KEGG 的核心是人工绘制的通路图，这些“分子连线图”根据已发表文献整理而成；另一项长期工作是 KO（KEGG Orthology）功能直系同源体系，用来在分子网络中表示基因和蛋白的功能。借助 KEGG 映射流程，研究者可以从一个物种的基因组中推断其系统功能，因此 KEGG 被广泛用于生物大数据分析。
除基础研究外，KEGG 也延伸到健康科学应用：日本和美国所有上市药品的说明书信息，已与 KEGG 自有的药物和疾病数据库整合。官网目前按数据库划分为 Pathway、Brite、Module、KO、Genes、化合物等化学数据，以及 Disease、Drug 和 Medicus 等板块；2026年10月1日发布了新版本说明，并公告 KEGG 已重组为23类数据对象。工具方面有用于映射的 KEGG Mapper、KEGG Syntax，用于自动注释的 BlastKOALA 和 GhostKOALA，以及 KEGG API、KGML 和 DBGET 检索系统。
KEGG 由金久实验室开发并享有版权。官方版权声明写明，学术用户可以免费使用 kegg.jp 网站及 GenomeNet 上的镜像站 genome.jp/kegg；若学术机构利用 KEGG 对外提供服务，则需要取得学术服务提供者许可，该许可包含在 KEGG FTP 学术订阅中。对非学术用户，官方特别说明 KEGG 不是公共数据库，也没有公共资金支持，商业使用必须取得商业许可，由运营 KEGG FTP 站点和商业镜像站的 Pathway Solutions 负责签约。金久实验室同时声明不对数据的准确性或适用性承担法律责任。
Pathway Solutions 提供两类主要许可：面向最终用户的 EULA，允许企业内部下载和使用 KEGG FTP 数据，可选附带访问商业镜像站及 KEGG API 的权限；以及面向利用 KEGG 提供服务的企业的 SPLA。许可以法人为单位授予，不含海外分支机构，另有集团许可和适用于跨国企业的企业许可，相关条款不接受协商。KEGG 官方建议使用者在论文中引用指定文献，例如2025年发表于《Nucleic Acids Research》的 KEGG 介绍文章。
对中国用户而言，KEGG 官网提供英文和日文界面，没有中文版本；学术用户可直接使用官网或 GenomeNet 镜像站，企业用户则需先向 Pathway Solutions 办理许可。评价 KEGG 时，有参考价值的信息包括：使用的数据库或工具名称、研究领域、物种覆盖是否满足需要、通路图与注释的更新及时性、API 和 FTP 的使用体验，以及企业用户办理商业许可的流程和沟通效率。